Calculadora Kd de Bioquímica
Calcula la constante de disociación en equilibrio (Kd) y la energía libre de Gibbs (ΔG) para una reacción de unión proteína-ligando con conversión automática de unidades (nM, µM, mM, M).
Calculadora de Constante de Disociación
Reacción: P + L ⇌ PL
Kd = ([P] × [L]) / [PL] — un Kd más bajo indica una unión más fuerte.
El valor estándar es 298.15 K (25 °C). ΔG = R·T·ln(Kd), R = 8.314 J/(mol·K).
Constante de Disociación (Kd)
—
Energía Libre de Unión (ΔG°bind)
—
Unión Proteína-Ligando y la Constante de Disociación
En bioquímica, Kd (la constante de disociación en equilibrio) cuantifica la afinidad entre una proteína y su ligando. El equilibrio subyacente es la reacción reversible P + L ⇌ PL. Un Kd menor significa que el complejo es más estable y la unión es más fuerte. Esta calculadora convierte automáticamente todas las unidades a molar internamente.
Interpretación de los Valores de Kd
Kd representa la concentración de ligando libre a la cual la mitad de los sitios de unión de la proteína están ocupados. Un Kd en nanomolar bajo (nM) representa una interacción de alta afinidad.
- nM Bajo (1–10 nM): alta afinidad, típica de interacciones fármaco-diana aprobadas.
- nM Alto a µM Bajo (100 nM–1 µM): afinidad moderada, común en compuestos iniciales.
- µM Alto a mM (10 µM–1 mM): unión débil, a menudo no específica.
Energía Libre de Gibbs y Termodinámica
La relación termodinámica viene dada por la energía libre de Gibbs, calculada como ΔG = R × T × ln(Kd). Un ΔG negativo indica una reacción de unión espontánea y favorable.
Por Qué Importa la Conversión de Unidades
Los experimentos bioquímicos reportan concentraciones en diferentes unidades (nM, µM, mM). Mezclar unidades en cálculos manuales es una fuente frecuente de errores. La calculadora gestiona esto convirtiendo todo a molar (M).
Preguntas Frecuentes
¿Qué es la constante de disociación Kd?
Kd es la concentración de ligando libre en la que la mitad de los sitios de unión de la proteína están ocupados. Un Kd más pequeño indica una interacción de unión más fuerte.
¿Cómo se relaciona la energía libre de Gibbs con Kd?
La energía libre de Gibbs (ΔG) se calcula mediante la fórmula ΔG = R × T × ln(Kd). Un ΔG negativo indica una reacción espontánea.
¿Qué unidades debo usar para los cálculos de Kd?
Acepta entradas en nanomolar (nM), micromolar (µM), milimolar (mM) y molar (M). Todos los valores se convierten internamente.
¿Cuál es un buen valor de Kd para la unión de un fármaco?
Para la unión fármaco-diana, un Kd en el rango nanomolar bajo (nM) o inferior se considera fuerte y típico de fármacos eficaces.