Kalkulator Kd Biokimia
Hitung konstanta disosiasi kesetimbangan (Kd) dan energi bebas Gibbs (ΔG) untuk reaksi ikatan protein-ligan — dengan konversi unit otomatis (nM, µM, mM, M).
Kalkulator Konstanta Disosiasi
Reaksi: P + L ⇌ PL
Kd = ([P] × [L]) / [PL] — Kd yang lebih rendah berarti ikatan lebih kuat.
Standar adalah 298.15 K (25 °C). ΔG = R·T·ln(Kd), R = 8.314 J/(mol·K).
Konstanta Disosiasi (Kd)
—
Energi Bebas Ikatan (ΔG°bind)
—
Ikatan Protein-Ligan dan Konstanta Disosiasi
Dalam biokimia, Kd mengukur afinitas antara protein dan ligannya. Nilai Kd yang lebih rendah menunjukkan ikatan yang lebih kuat. Kalkulator ini mengonversi semua input ke molar secara internal.
Menerjemahkan Nilai Kd
Kd adalah konsentrasi ligan bebas di mana separuh situs ikatan protein terisi. Nilai nM rendah menunjukkan interaksi afinitas tinggi.
- nM Rendah (1–10 nM): afinitas tinggi, khas untuk obat yang disetujui.
- nM Tinggi hingga µM Rendah (100 nM–1 µM): afinitas sedang.
- µM Tinggi hingga mM (10 µM–1 mM): ikatan lemah atau non-spesifik.
Energi Bebas Gibbs dan Termodinamika
Energi bebas Gibbs dihitung dengan rumus ΔG = R × T × ln(Kd). Nilai ΔG negatif menunjukkan reaksi yang spontan.
Pentingnya Konversi Unit
Eksperimen melaporkan konsentrasi dalam unit berbeda. Kalkulator ini secara otomatis mengonversi semuanya ke molar (M) untuk menghindari kesalahan.
Pertanyaan yang Sering Diajukan
Apa itu konstanta disosiasi Kd?
Kd adalah konsentrasi ligan bebas di mana setengah dari situs ikatan terisi. Semakin kecil Kd, semakin kuat ikatannya.
Bagaimana hubungan energi bebas Gibbs dengan Kd?
Dihitung menggunakan ΔG = R × T × ln(Kd). Nilai negatif menunjukkan reaksi spontan.
Unit apa yang harus saya gunakan?
Anda dapat menggunakan nM, µM, mM, dan M. Semua dikonversi secara otomatis.
Berapa nilai Kd yang bagus untuk ikatan obat?
Rentang nanomolar rendah (nM) dianggap kuat dan ideal untuk kandidat obat.